碩士班課程
每學期開課資訊請由成功大學『課程查詢系統(另開視窗)』及查詢(工科所代號：工學院 N9)，選課日期請注意『教務處』『註冊組』最新消息公告，選課請由『成功入口』登入，依公告選課日期進行選課。
本系研究所教育目標，(1) 培育專業領域之研究人才 (2) 養成系統整合、分析及協調之能力 (3) 擴展國際視野及強化自我學習之活力。在課程之設計上，主要目的在培養學生於畢業後應具備之核心能力為而規劃。本系研究所目前依師資專長，分為6個組別，甲組為電機控制與訊號處理、乙組為資訊與通訊、丙組為電子構裝與力學、丁組為微奈米與半導體製程熱流、戊組為光機電系統整合與己組為微奈米生醫系統與光電工程。各組課程規劃除本所規定之理論基礎核心課程外，在其專業領域之課程規劃上，以考量學生之興趣及產業未來發展需求為重點，使學生在所屬專業領域上能有更精進之探索；另為使學生能有多元化學習及國際視野，每星期均有安排有不同領域之專題演講，使學生能學習到不同專業領域之專業知能。
本所課程依教師專長及招生分組的領域，分成「電機控制與通訊」、「資訊與應用」、「奈米生醫與量子電腦」、「應用力學」、「系統整合」等5個研究組別，各組課程規劃除本所規定之基礎理論課程外，在其專業領域之課程規劃上，以考量學生之興趣及產業未來發展需求為重點，使學生在所屬專業領域上能有更精進之探索。
甲、控制與通訊：電機控制與通訊，控制分析與設計及自動化，從控制系統、電子電路結合應用力學完成結構體設計，實現系統自動化。
乙、資訊工程與應用：嵌入式系統、數位學習系、大數據系統、資料庫系統、醫療資訊系統、應用資訊系統、人工智慧、資訊安全及其它領域的整合應用。
丙、奈米生醫與量子電腦：微奈米科技、微機電系統、量子科技、量子資訊、量子控制、量子生物學。
丁、應用力學(固力)：系統構裝、壓電結構、複合材料、應用力學、固體力學。
戊、應用力學(熱流)：半導體製程、電子構裝熱流、微流體晶片、生物晶片、鑄模與金屬熱傳、風能與大渦模擬。
己、系統整合：光機電系統整合。
畢業學分規定24學分(含核心課程)
專業選修科目至少24學分以上
論文 6 學分另計
專題研討 4 學期，必須依順序修課，且不得重複選修
